Diversité génétique
Vegenov utilise des outils de génétique et génomique (de quelques dizaines de SSR à plusieurs centaines, voir millier de SNP) pour évaluer la diversité génétique au sein de populations de plantes, fournissant des informations cruciales pour la gestion des ressources génétiques et l’optimisation des programmes de sélection végétale.
Développement de marqueurs génétiques pour la sélection
Vegenov propose de réaliser des analyses d’association génomique (GWAS) par le biais de génotypage haut débit associé à du phénotypage pour identifier les variations génétiques liées à des traits spécifiques. Nous pouvons ainsi développer des marqueurs de novo, permettant d’optimiser les programmes de création variétale.
Sélection assistée par marqueurs
Vegenov développe et utilise en routine des marqueurs moléculaires (SSR, SNP, …) pour vous aider à accélérer le retour au fond génétique récurrent et accélérer l’introgression de caractères d’intérêt.
- Recherche de marqueurs moléculaires du fond génétique ou liés à des régions génomiques contrôlant des caractères d’intérêt
- Caractérisation des génotypes parentaux
- Criblage de vos descendances en cours de sélection par génotypage, à un stade de développement très précoce, avec des marqueurs du fond génétique et/ou des marqueurs liés à des loci d’intérêt (gènes majeurs ou QTL)
Nous proposons des marqueurs pour des analyses en routine sur un large panel d’espèces potagères, fruitières et de grandes cultures (par exemple tomate, alliums, piment-poivron, pêcher, abricotier, blé, riz…).
Nous pouvons également développer de nouveaux marqueurs selon vos besoins.
Identification variétale
Vegenov développe et met en œuvre des bases de données d’empreintes génétiques de nombreuses espèces (tomate, melon, courgette, palmier-dattier, …), basées sur l’utilisation de marqueurs moléculaires (SSR et SNP) pour :
- Protéger vos variétés contre leur multiplication illégale par d’autres obtenteurs ou pour résoudre des litiges avec vos clients et/ou fournisseurs.
- Assurer la traçabilité de vos variétés et de leurs lignées parentales tout au long de votre processus de production de lots de semences ou de jeunes plants.
Pureté génétique
Vegenov développe des bases de données d’empreintes génétiques de variétés et de lignées parentales d’un panel d’espèces végétales afin de contrôler l’homogénéité et détecter des contaminations possibles de vos lots de semences (détection des autofécondations et des hors-types).
Qualité sanitaire
Pour vous aider à garantir la qualité sanitaire de vos productions, Vegenov développe et utilise des tests de détection et de quantification moléculaire d’agents pathogènes (virus, bactéries, champignons) à partir d’échantillons de terres, d’eau, de semences, de feuilles… Ces tests sont basés sur la recherche d’un fragment d’ADN cible de l’agent pathogène recherché, grâce à des marqueurs moléculaires. Ils ont l’avantage d’être très spécifiques et très sensibles (détection possible avant apparition des symptômes visibles à l’œil). Nous proposons également de la détection non ciblée (barcoding ou métabarcoding) afin d’identifier le ou les micro-organismes présent(s) dans un échantillon, sans a priori.
